Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms