Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN2P17655 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN2P17655 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN2P17655 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN2P17655 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN2P17655 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN2P17655 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN2P17655 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN2P17655 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms