Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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