Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8BP10966 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD8BP10966 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD8BP10966 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD8BP10966 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD8BP10966 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD8BP10966 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD8BP10966 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD8BP10966 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD8BP10966 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8BP10966 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms