Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms