Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4BP0C0L5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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