Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PF4P02776 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PF4P02776 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PF4P02776 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PF4P02776 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PF4P02776 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PF4P02776 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PF4P02776 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PF4P02776 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PF4P02776 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PF4P02776 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PF4P02776 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms