Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC1P02654 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms