Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA3O96018 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA3O96018 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APBA3O96018 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APBA3O96018 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APBA3O96018 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA3O96018 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA3O96018 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA3O96018 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA3O96018 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA3O96018 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA3O96018 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA3O96018 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA3O96018 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA3O96018 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA3O96018 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA3O96018 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA3O96018 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA3O96018 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA3O96018 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA3O96018 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA3O96018 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA3O96018 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA3O96018 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA3O96018 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA3O96018 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA3O96018 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA3O96018 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA3O96018 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA3O96018 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA3O96018 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA3O96018 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA3O96018 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA3O96018 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA3O96018 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms