Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf47O95873 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms