Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms