Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHP4O75161 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms