Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms