Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF5BO60841 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms