Protein–RNA interactions for Protein: O43916

CHST1, Carbohydrate sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST1O43916 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHST1O43916 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHST1O43916 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHST1O43916 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms