Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYT7O43581 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT7O43581 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT7O43581 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms