Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OIP5O43482 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OIP5O43482 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OIP5O43482 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OIP5O43482 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OIP5O43482 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OIP5O43482 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OIP5O43482 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OIP5O43482 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OIP5O43482 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OIP5O43482 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OIP5O43482 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OIP5O43482 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OIP5O43482 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OIP5O43482 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OIP5O43482 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms