Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRODHO43272 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRODHO43272 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRODHO43272 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRODHO43272 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRODHO43272 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRODHO43272 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRODHO43272 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRODHO43272 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRODHO43272 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRODHO43272 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRODHO43272 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRODHO43272 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRODHO43272 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRODHO43272 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRODHO43272 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRODHO43272 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRODHO43272 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRODHO43272 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRODHO43272 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRODHO43272 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRODHO43272 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRODHO43272 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRODHO43272 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRODHO43272 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRODHO43272 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms