Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms