Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PCH4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PCH4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PCH4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PCH4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PCH4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PCH4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PCH4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PCH4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PCH4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PCH4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PCH4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PCH4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
E9PCH4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PCH4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E9PCH4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E9PCH4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E9PCH4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E9PCH4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E9PCH4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E9PCH4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E9PCH4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E9PCH4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E9PCH4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E9PCH4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E9PCH4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E9PCH4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms