Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms