Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms