Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms