Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms