Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms