Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms