Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms