Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms