Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms