Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms