Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBE1Q9UJT0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms