Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFMBT1Q9UHJ3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms