Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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