Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VTI1BQ9UEU0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms