Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms