Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms