Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SH3BP4Q9P0V3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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