Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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