Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms