Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms