Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECTIN3Q9NQS3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms