Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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LHX9Q9NQ69 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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LHX9Q9NQ69 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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LHX9Q9NQ69 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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