Protein–RNA interactions for Protein: Q9H930

SP140L, Nuclear body protein SP140-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140LQ9H930 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SP140LQ9H930 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140LQ9H930 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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