Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms