Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms