Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIPCQ9C0C6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms