Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BCO2Q9BYV7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms