Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms