Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms