Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms